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農業部臺中區農業改良場

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專訊第26期

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聚合鋂連鎖反應在品種鑑定上之應用~文心蘭核糖體內轉錄間隔區之分子標誌

聚合鋂連鎖反應在品種鑑定上之應用~ 文心蘭核糖體內轉錄間隔區之分子標誌

 

台中區農業改良場/蔡奇助、黃勝忠

 

  文心蘭 ( Oncidium spp.) 為蘭科 (Orchidaceae) 文心蘭屬 ( Oncidium ) 植物,此類植物原產於熱帶美洲地區,已發現700多種原生種。植株特性大多為氣生性之複莖軸蘭,但亦有少數種類為地生蘭。大多數的文心蘭植株與其近親菫花蘭 ( Miltonias )及齒舌蘭 ( Odontoglossums )十分相近,有的屬於扁平假球莖型;有些品種葉稍圓似洋蔥之葉片如 Onc. stiptatum ;有些則葉片小如扇形之鳶尾葉如 Onc. triquetrum 。文心蘭屬( Oncidium)植物與其近親屬容易雜交,如菫花蘭( Miltonias),齒舌蘭 ( Odontoglossums ),蜘蛛蘭屬等,因此上述各屬與其雜交品種皆通稱為文 心蘭。

  文心蘭花形特殊,花色變化多,是極佳的切花花材;且花期又長,適合各種場合擺設。近年來,由於台灣花藝設計之題材多樣化,及花材變化與需求大增,故使文心蘭漸受青睞。而且台灣氣候環境條件十分適合生產文心蘭,使文心蘭成為目前台灣新興栽培花卉之一。為了育成高品質文心蘭,品種的鑑定、純度分析及品種間的遺傳距離即相當重要,本研究在建立一套品種指紋技術,以提高未來育種效率。

  我們利用PCR-amplified RFLP 指紋技術來分析,此技術是聚合鋂連鎖反應 (polymerase chain reaction, 簡稱 PCR) 之衍生,應用於分析各文心蘭品種核糖體核酸 (rDNA) 之內轉錄區間隔 區 ( 簡稱 ITS) 。共參試 24 個文心蘭品種,包含 14 個文心蘭屬品種、 2 個蓳花蘭屬品種、 1 個蜘蛛 蘭屬品種及 7 個雜交屬品種。由基因庫中設計一組引子,利用 PCR 將文心蘭品種 rDNA 之 ITS DNA 片斷大量複製。其長度約 715 bp ,各文心蘭品種之 ITS 在長度上並無差異。為進一步確定 此 PCR 產物為 ITS 區域,取其中一樣本進行定序,經送入基因庫比對,證實為 rDNA 之 ITS 區 域。之後利用限制?”荌輕?U文心蘭品種之 ITS 序列差異,共使用 Cfo I, Eco RV, Hinf I, Hae III, Rsa I, Bst OI, Hsp92II, Taq I, Mva I 及 Msp I 等 10 種限制鋂 。總計可記錄 166 個分子分標誌,其中有 159 個標誌具多型性 (polymorphism) 。這些分子標誌即可應用於品種鑑定及育種上。另外,將 上述分子標誌換算出樣本兩兩間相似度,再經由不加權平均法 (UPGMA) 行群叢分析,完成樹 狀關係圖,由樹狀關係圖可判定各文心蘭品種之親緣關係。

  由上述研究可顯示,利用 PCR-amplified RFLP 來分析文心蘭 rDNA 之 ITS 區域,確可獲取不少有用的分子標誌,應用在文心蘭品種的鑑定與育種的研究甚有幫助,並可進一步應用在親 緣研究。

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